Nečistoće koje plutaju u vodi unutar hidroničkih krugova mogu uzrokovati probleme koje ne treba podcjenjivati.
- Nepravilan rad ventila: to je zbog nečistoća, koje se mogu zaglaviti i uzrokovati lošu regulaciju, kao i curenje, kao što je između ostalog kod ventila za balansiranje
- Blokiranje i začepljenje pumpi: ovi problemi mogu biti uzrokovani suspendiranim česticama koje cirkuliraju kroz pumpe koje se mogu zaglaviti u njima, zbog njihove posebne geometrije i učinka magnetskih polja koja stvaraju same pumpe
- Niža učinkovitost izmjenjivača topline: naslage i nakupljanje kamenca mogu značajno smanjiti protok medija i površina za izmjenu topline.
Ugradnja filtra za odvajanje prljavštine uklanja nečistoće sadržane u mediju i jamči udobnost korisnika.