Komponente sistema za grejanje i hlađenje su izložene degradaciji izazvanoj nečistoćama koje cirkulišu u toplotnom medijumu. Ako se nečistoće ne uklone mogu izazvati blokadu i zaglavljivanje pumpi, smanjenu efikasnost izmenjivača toplote, nepouzdan rad ventila i nedovoljnu razmenu toplote.
U specifičnom slučaju sistema toplotnih pumpi, preporučuje se upotreba magnetnog filtera za odvajanje nečistoće. Nečistoće mogu zapravo dovesti u opasnost od blokade ionako male prostore za cirkulaciju ili sprečiti da uređaji za podešavanje pravilno rade. Pošto je toplotna pumpa generator koji koristi male temperaturne razlike, čak i male promene protoka mogu negativno uticati na njenu efikasnost. Što je veće dejstvo filtriranja magnetnog filterskog separatora nečistoće, duže će se održavati visoka efikasnost sistema toplotne pumpe.
